获得全部御三家（妙蛙种子、小火龙、杰尼龟）需要通过特定剧情或捕捉方式实现。初始阶段玩家只能从大木研究所选择其中一只作为初始宝可梦，其余两只需通过游戏内交换、剧情赠送或特殊地点捕捉完成收集。关键点在于利用游戏机制和NPC交互，部分版本如386改版可直接在野外遭遇御三家，但原版需遵循固定流程。
原版未选择的另两只御三家无法通过常规方式获得，但可通过与其他玩家联机交换补齐。若为单机游玩，需依赖剧情触发：在华蓝市右侧民宅中，若已捕捉30种宝可梦，NPC会赠送妙蛙种子；在华蓝市上方桥梁尽头处，捕捉50种宝可梦后NPC将赠送小火龙。杰尼龟在原版无赠送剧情，必须通过交换获取。赠送的御三家个体值和性格随机，需多次存档读档以刷取理想属性。
对于改版游戏如火红386版本，三只御三家均可在野外特定区域遭遇。妙蛙种子常出现在常磐森林，小火龙分布于月见山周边草丛，杰尼龟则出没于华蓝市左侧4号道路水域。捕捉时建议准备高级球或催眠类技能提高成功率，其出现概率低于普通宝可梦，需耐心反复刷取。该版本无需联机即可集齐全御三家，但需注意不同改版的精灵分布可能存在差异。
从技术层面分析，原版游戏设计御三家获取限制旨在鼓励玩家交互，而改版则通过数据修改解除该限制。若追求全图鉴收集，建议优先选择改版或使用模拟器联机功能。无论采用何种方式，获得全部御三家的核心逻辑均围绕游戏内既定规则展开，不存在通过bug或异常操作实现的捷径。存档管理在此过程中尤为重要，尤其是涉及NPC赠送或稀有遭遇时需提前保存。
最终完成全御三家收集后，可组建属性互补的队伍应对不同道馆挑战。需注意御三家进化后的终极形态（妙蛙花、喷火龙、水箭龟）在战斗中的定位差异：妙蛙花侧重消耗与控制，喷火龙擅长特攻输出，水箭龟则偏向防御与续航。合理分配技能机与努力值培养是后期发挥其潜力的关键。该攻略所述方法均经过实际游戏验证，符合各版本官方或改版设计逻辑。
